Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTR1BP42025 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTR1BP42025 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms