Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCTD3Q9Y597 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD3Q9Y597 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD3Q9Y597 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms