Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DTX4Q9Y2E6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DTX4Q9Y2E6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms