Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCTPQ9UKL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCTPQ9UKL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCTPQ9UKL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms