Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK-6Q9BXR3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK-6Q9BXR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms