Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRNP25Q9BV90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRNP25Q9BV90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms