Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GORASP1Q9BQQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GORASP1Q9BQQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GORASP1Q9BQQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms