Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCLRE1CQ96SD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DCLRE1CQ96SD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms