Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC35A4Q96G79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC35A4Q96G79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms