Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF19Q5T6S3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF19Q5T6S3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms