Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 SPG4YMR107W 348 nt5.44□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 GEP3YOR205C 1671 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 IML2YJL082W 2196 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 SVF1YDR346C 1446 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 YDL144CYDL144C 1071 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 MAD2YJL030W 591 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 PIN2YOR104W 849 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 PCS60YBR222C 1632 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 RKM4YDR257C 1485 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 RBA50YDR527W 1320 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 NRD1YNL251C 1728 nt5.43□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 YJL193WYJL193W 1209 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 TOM40YMR203W 1164 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 QDR1YIL120W 1692 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 HAP1YLR256W 4509 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 SSY5YJL156C 2100 nt5.42□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 STE12YHR084W 2067 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 PIC2YER053C 903 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 YJL107CYJL107C 1164 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 RHO4YKR055W 876 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 MAC1YMR021C 1254 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 TAH18YPR048W 1872 nt5.41□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 ATE1YGL017W 1512 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 YDL034WYDL034W 345 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 COX26YDR119W-A 201 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 PRS1YKL181W 1284 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 SNO4YMR322C 714 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 RPC19YNL113W 429 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 LEM3YNL323W 1245 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 HSP33YOR391C 714 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 HSP32YPL280W 714 nt5.4□□□□□ -1.54
SPE4Q12455 ATG32YIL146C 1590 nt5.4□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 SPC97YHR172W 2472 nt5.4□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 EIS1YMR031C 2532 nt5.4□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YEL020CYEL020C 1683 nt5.4□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 NSI1YDR026C 1713 nt5.4□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 UBX2YML013W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 DAK1YML070W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YIL077CYIL077C 963 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 GPM3YOL056W 912 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 STE50YCL032W 1041 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YHR045WYHR045W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 HER2YMR293C 1395 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 DUG1YFR044C 1446 nt5.39□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 GIP2YER054C 1647 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YFL034WYFL034W 3222 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 IMG2YCR071C 441 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YLL059CYLL059C 507 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 LST8YNL006W 912 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 RPS19BYNL302C 435 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 DXO1YDR370C 1329 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 TKL1YPR074C 2043 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 SYG1YIL047C 2709 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 DHH1YDL160C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 PMA1YGL008C 2757 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 CTF18YMR078C 2226 nt5.38□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 TAX4YJL083W 1815 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 PPR1YLR014C 2715 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 ASP1YDR321W 1146 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 RML2YEL050C 1182 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 MPM1YJL066C 759 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YPL102CYPL102C 303 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 KIP2YPL155C 2121 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 ALT1YLR089C 1779 nt5.37□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YEL028WYEL028W 462 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 IRC7YFR055W 1023 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YKR075CYKR075C 924 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 GTR1YML121W 933 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YOR024WYOR024W 324 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YOR292CYOR292C 930 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 ARR3YPR201W 1215 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 BIT2YBR270C 1638 nt5.36□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 CCZ1YBR131W 2115 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 APE1YKL103C 1545 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 DFG5YMR238W 1377 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 ULA1YPL003W 1389 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 HES1YOR237W 1305 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 RTN1YDR233C 888 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 UBC6YER100W 753 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YGL118CYGL118C 438 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 MRF1YGL143C 1242 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 SKI8YGL213C 1194 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 RPA49YNL248C 1248 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 ROX3YBL093C 663 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 CPA1YOR303W 1236 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 SCO1YBR037C 888 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 UBA3YPR066W 900 nt5.35□□□□□ -1.55
SPE4Q12455 MST1YKL194C 1389 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms