Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX4Q06945 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX4Q06945 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms