Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 SEG2YKL105C 3399 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 PHO90YJL198W 2646 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 PAN6YIL145C 930 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 YJL211CYJL211C 444 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 SHP1YBL058W 1272 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 HAL1YPR005C 885 nt5.41□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 FUM1YPL262W 1467 nt5.4□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 YIL067CYIL067C 2037 nt5.4□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 RHO2YNL090W 579 nt5.4□□□□□ -1.54
YMR111CQ04461 PRT1YOR361C 2292 nt5.39□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SAP155YFR040W 3009 nt5.39□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 ASK10YGR097W 3441 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 GIP2YER054C 1647 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 KRS1YDR037W 1776 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 UPS3YDR185C 540 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YGR122WYGR122W 1209 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SNO4YMR322C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 HSP33YOR391C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 HSP32YPL280W 714 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 BAP2YBR068C 1830 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 HPC2YBR215W 1878 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SRV2YNL138W 1581 nt5.38□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 PRP43YGL120C 2304 nt5.37□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YDR154CYDR154C 351 nt5.37□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YPR098CYPR098C 486 nt5.37□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 TRK2YKR050W 2670 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 GPR1YDL035C 2886 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YDL144CYDL144C 1071 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 PGA3YML125C 939 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 LST8YNL006W 912 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 MRL1YPR079W 1146 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 TEF1YPR080W 1377 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 TEF2YBR118W 1377 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 RCK1YGL158W 1539 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 PDH1YPR002W 1551 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SEC9YGR009C 1956 nt5.36□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SHE10YGL228W 1734 nt5.35□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 UTP7YER082C 1665 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SEC12YNR026C 1416 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 HEM3YDL205C 984 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YKL031WYKL031W 414 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 SPG4YMR107W 348 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 YBL044WYBL044W 369 nt5.34□□□□□ -1.55
YMR111CQ04461 ACF2YLR144C 2340 nt5.34□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 MTQ2YDR140W 666 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YIL060WYIL060W 435 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 SEN34YAR008W 828 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 REC114YMR133W 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 PGA2YNL149C 390 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YNR048WYNR048W 1182 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 BUB3YOR026W 1026 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 GRE1YPL223C 507 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 ARR3YPR201W 1215 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HXT3YDR345C 1704 nt5.33□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 BLM10YFL007W 6432 nt5.32□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HLJ1YMR161W 675 nt5.32□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 SPS18YNL204C 903 nt5.32□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YOR200WYOR200W 399 nt5.32□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 FAA3YIL009W 2085 nt5.32□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 CLA4YNL298W 2529 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 ZUO1YGR285C 1302 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YDL034WYDL034W 345 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 CNL1YDR357C 369 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 ZRT1YGL255W 1131 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 LCB2YDR062W 1686 nt5.31□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 DAL81YIR023W 2913 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 MBP1YDL056W 2502 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 UBP9YER098W 2265 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 ACC1YNR016C 6702 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 ALG2YGL065C 1512 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 MRP17YKL003C 396 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HOR7YMR251W-A 180 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 MRPL22YNL177C 930 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HPF1YOL155C 2904 nt5.3□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HFI1YPL254W 1467 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 LUC7YDL087C 786 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 COX26YDR119W-A 201 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 HST4YDR191W 1113 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 PIN2YOR104W 849 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 SYG1YIL047C 2709 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 SSY5YJL156C 2100 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 UBP7YIL156W 3216 nt5.29□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 DED81YHR019C 1665 nt5.28□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 PTR2YKR093W 1806 nt5.28□□□□□ -1.56
YMR111CQ04461 SIF2YBR103W 1608 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms