Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTP1P59025 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTP1P59025 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RTP1P59025 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTP1P59025 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTP1P59025 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTP1P59025 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP1P59025 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP1P59025 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP1P59025 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP1P59025 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP1P59025 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP1P59025 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP1P59025 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP1P59025 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP1P59025 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP1P59025 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP1P59025 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP1P59025 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP1P59025 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP1P59025 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP1P59025 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP1P59025 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP1P59025 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP1P59025 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP1P59025 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP1P59025 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP1P59025 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP1P59025 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP1P59025 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RTP1P59025 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP1P59025 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP1P59025 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms