Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHKA1P46020 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHKA1P46020 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHKA1P46020 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms