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Protein–RNA interactions for Protein: P40317
SOK1, Protein SOK1, yeast
Predictions only
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901 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SOK1
P40317
RPA49
YNL248C
1248 nt
4.99
□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
YOR024W
YOR024W
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
HES1
YOR237W
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
ELP2
YGR200C
2367 nt
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
SOG2
YOR353C
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
RPS19B
YNL302C
435 nt
4.98
□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
MKC7
YDR144C
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4.98
□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
GAS3
YMR215W
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
PDI1
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□□□□□ -1.61
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P40317
RTT106
YNL206C
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
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tN(GUU)F
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4.97
□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
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tN(GUU)G
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□□□□□ -1.61
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P40317
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tN(GUU)K
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□□□□□ -1.61
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P40317
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□□□□□ -1.61
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P40317
tN(GUU)N1
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
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tN(GUU)N2
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
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SOK1
P40317
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SOK1
P40317
tN(GUU)P
tN(GUU)P
74 nt
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
YML131W
YML131W
1098 nt
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
ARG1
YOL058W
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
SNF3
YDL194W
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
DAL81
YIR023W
2913 nt
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□□□□□ -1.61
SOK1
P40317
KIP2
YPL155C
2121 nt
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
ARP2
YDL029W
1176 nt
4.96
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YLL059C
YLL059C
507 nt
4.96
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
GPM3
YOL056W
912 nt
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
CTS1
YLR286C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
PHO90
YJL198W
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
CAX4
YGR036C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YJR115W
YJR115W
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SOK1
P40317
XPT1
YJR133W
630 nt
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SOK1
P40317
SCO1
YBR037C
888 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YHR045W
YHR045W
1683 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YMD8
YML038C
1329 nt
4.95
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
CAD1
YDR423C
1230 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
MLC1
YGL106W
450 nt
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YLR118C
YLR118C
684 nt
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YLR346C
YLR346C
306 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
snR10
snR10
245 nt
4.94
□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YBR230W-A
YBR230W-A
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YHR182W
YHR182W
2358 nt
4.94
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SOK1
P40317
PEX19
YDL065C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
RPS16B
YDL083C
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SOK1
P40317
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YER187W
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
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YOL097W-A
186 nt
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SOK1
P40317
UBP9
YER098W
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SOK1
P40317
ULA1
YPL003W
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
EEB1
YPL095C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YIL067C
YIL067C
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SOK1
P40317
NGR1
YBR212W
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SOK1
P40317
ATG20
YDL113C
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SOK1
P40317
TIM54
YJL054W
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SOK1
P40317
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YFL064C
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SOK1
P40317
CAR1
YPL111W
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SOK1
P40317
CBC2
YPL178W
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SOK1
P40317
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YPR202W
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SOK1
P40317
PUS1
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SOK1
P40317
CDC4
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SOK1
P40317
VHS2
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SOK1
P40317
CUE2
YKL090W
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SOK1
P40317
SEG2
YKL105C
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SOK1
P40317
PSE1
YMR308C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
YGL036W
YGL036W
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SOK1
P40317
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YDL034W
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SOK1
P40317
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YFR035C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
ROX3
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
ISU2
YOR226C
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
NOC4
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□□□□□ -1.62
SOK1
P40317
TUP1
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SOK1
P40317
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SOK1
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SOK1
P40317
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SOK1
P40317
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P40317
SFK1
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P40317
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YKL151C
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SOK1
P40317
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SOK1
P40317
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YFL033C
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SOK1
P40317
ADE6
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SOK1
P40317
SEC9
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SOK1
P40317
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P40317
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P40317
SUA5
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P40317
YGR182C
YGR182C
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P40317
COS9
YKL219W
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SOK1
P40317
CTR3
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SOK1
P40317
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SOK1
P40317
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SOK1
P40317
TEA1
YOR337W
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□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
KNH1
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□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
YER084W
YER084W
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□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
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□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
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YLR194C
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SOK1
P40317
RPL21B
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4.88
□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
VPS72
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□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
ARN1
YHL040C
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4.88
□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
STE20
YHL007C
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4.87
□□□□□ -1.63
SOK1
P40317
GLT1
YDL171C
6438 nt
4.87
□□□□□ -1.63
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