Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN7P35236 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms