Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	YJR015W	YJR015W	1533 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	SRG1	SRG1	551 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	PRO3	YER023W	861 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	MMP1	YLL061W	1752 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	UBX2	YML013W	1755 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	PHO8	YDR481C	1701 nt		5.85	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	ADE13	YLR359W	1449 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	RIM101	YHL027W	1878 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	RPT6	YGL048C	1218 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	VAM7	YGL212W	951 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	YKL223W	YKL223W	333 nt		5.84	□□□□□ -1.47
RPC53	P25441	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	NOB1	YOR056C	1380 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	MHR1	YDR296W	681 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YOR318C	YOR318C	306 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YFL034W	YFL034W	3222 nt		5.83	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	GET3	YDL100C	1065 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YHR127W	YHR127W	732 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	MND2	YIR025W	1107 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YIR007W	YIR007W	2295 nt		5.82	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	GON7	YJL184W	372 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	CBF1	YJR060W	1056 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	SAM4	YPL273W	978 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	VPS70	YJR126C	2436 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.81	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YGR139W	YGR139W	339 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	IPI1	YHR085W	1005 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	RPS19B	YNL302C	435 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YCL041C	YCL041C	495 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	DPH2	YKL191W	1605 nt		5.8	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	POM33	YLL023C	840 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ERG3	YLR056W	1098 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	GPM3	YOL056W	912 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	SUE1	YPR151C	621 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ULA1	YPL003W	1389 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.79	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ICE2	YIL090W	1476 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	CST6	YIL036W	1764 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YKR041W	YKR041W	753 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	MTF1	YMR228W	1026 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	ROX3	YBL093C	663 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	RER2	YBR002C	861 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	QDR1	YIL120W	1692 nt		5.78	□□□□□ -1.48
RPC53	P25441	OXP1	YKL215C	3861 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	GCS1	YDL226C	1059 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	TDH3	YGR192C	999 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	PRM10	YJL108C	1152 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	ADD37	YMR184W	597 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.77	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	APE1	YKL103C	1545 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	RRT7	YLL030C	342 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	YLR122C	YLR122C	378 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	SEC13	YLR208W	894 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	LEM3	YNL323W	1245 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	HSP26	YBR072W	645 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	ATG1	YGL180W	2694 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.76	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	RPT4	YOR259C	1314 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	VAN1	YML115C	1608 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	ASP1	YDR321W	1146 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	CTR2	YHR175W	570 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	LDB18	YLL049W	540 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.75	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	KIP2	YPL155C	2121 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	GAT4	YIR013C	366 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	YJL068C	YJL068C	900 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	SSO1	YPL232W	873 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	NDC1	YML031W	1968 nt		5.74	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	YAP1	YML007W	1953 nt		5.73	□□□□□ -1.49
RPC53	P25441	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.73	□□□□□ -1.49

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