Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ASF1AQ9Y294 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASF1AQ9Y294 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASF1AQ9Y294 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms