Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPF1Q9NWY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPF1Q9NWY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HPF1Q9NWY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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