Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECAP2Q9NVZ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms