Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A9Q8NBW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A9Q8NBW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms