Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF38AQ8NAV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38AQ8NAV1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF38AQ8NAV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms