Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2F4Q16254 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F4Q16254 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F4Q16254 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms