Protein–RNA interactions for Protein: P38789

SSF1, Ribosome biogenesis protein SSF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF1P38789 UIP3YAR027W 708 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 SEC65YML105C 822 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YBL036CYBL036C 774 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YMR178WYMR178W 825 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 LTO1YNL260C 597 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 CAF40YNL288W 1122 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 NPT1YOR209C 1290 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 SMK1YPR054W 1167 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 EFM2YBR271W 1260 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 QRI1YDL103C 1434 nt7.41□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YLL067CYLL067C 3618 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YDL158CYDL158C 309 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 COX20YDR231C 618 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 IRC6YFR043C 714 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YNL285WYNL285W 372 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 YOR292CYOR292C 930 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 MCH1YDL054C 1461 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 GSH2YOL049W 1476 nt7.4□□□□□ -1.22
SSF1P38789 ACO1YLR304C 2337 nt7.4□□□□□ -1.23
SSF1P38789 ICL1YER065C 1674 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 MRPL32YCR003W 552 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 TRR1YDR353W 960 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 LDS1YAL018C 978 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 GTR1YML121W 933 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 RRS1YOR294W 612 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 MET16YPR167C 786 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 GEF1YJR040W 2340 nt7.39□□□□□ -1.23
SSF1P38789 ARP3YJR065C 1350 nt7.38□□□□□ -1.23
SSF1P38789 ECM38YLR299W 1983 nt7.38□□□□□ -1.23
SSF1P38789 SHR3YDL212W 633 nt7.37□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt7.37□□□□□ -1.23
SSF1P38789 SSU72YNL222W 621 nt7.37□□□□□ -1.23
SSF1P38789 BDF2YDL070W 1917 nt7.37□□□□□ -1.23
SSF1P38789 UTP4YDR324C 2331 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 STE12YHR084W 2067 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YCR016WYCR016W 873 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YDR282CYDR282C 1245 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 BUD32YGR262C 786 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 IMP3YHR148W 552 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 HYM1YKL189W 1200 nt7.36□□□□□ -1.23
SSF1P38789 PCL2YDL127W 927 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 PRS2YER099C 957 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 TMT1YER175C 900 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YGR283CYGR283C 1026 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 PPE1YHR075C 1203 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 SNO1YMR095C 675 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 TFB6YOR352W 1032 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 HOS1YPR068C 1413 nt7.35□□□□□ -1.23
SSF1P38789 GEX2YKR106W 1848 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 LYS21YDL131W 1323 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 SKS1YPL026C 1509 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YPR1YDR368W 939 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 RPS5YJR123W 678 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 SFK1YKL051W 1062 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YLR124WYLR124W 345 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 LIP2YLR239C 987 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 AIM33YML087C 939 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YML090WYML090W 387 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 AAH1YNL141W 1044 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 STL1YDR536W 1710 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 YPR204WYPR204W 3099 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 EMP65YER140W 1671 nt7.34□□□□□ -1.23
SSF1P38789 PGM1YKL127W 1713 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 ENT5YDR153C 1236 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 DMA1YHR115C 1251 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 CTF8YHR191C 402 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 TFA2YKR062W 987 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 BSC4YNL269W 396 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 RPN8YOR261C 1017 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 ENV7YPL236C 1095 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 RPL21AYBR191W 483 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YML133CYML133C 4125 nt7.33□□□□□ -1.24
SSF1P38789 POP6YGR030C 477 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 LAC1YKL008C 1257 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 HRT3YLR097C 1035 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 RRT2YBR246W 1164 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 COQ6YGR255C 1440 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 TED1YIL039W 1422 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 MLF3YNL074C 1359 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 RSA4YCR072C 1548 nt7.32□□□□□ -1.24
SSF1P38789 CUS1YMR240C 1311 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 MDM10YAL010C 1482 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YDL114WYDL114W 927 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 HAT2YEL056W 1206 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YGR168CYGR168C 1131 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YHR214WYHR214W 612 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 SEC28YIL076W 891 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 PTM1YKL039W 1572 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 MEU1YLR017W 1014 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YAR066WYAR066W 612 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 VTS1YOR359W 1572 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 MRPS16YPL013C 366 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 BTS1YPL069C 1008 nt7.31□□□□□ -1.24
SSF1P38789 SIT4YDL047W 936 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 VPS61YDR136C 573 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 BUD26YDR241W 288 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YLR326WYLR326W 723 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 YIM2YMR151W 438 nt7.3□□□□□ -1.24
SSF1P38789 UIP4YPL186C 915 nt7.3□□□□□ -1.24
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