Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COMMD8Q9NX08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD8Q9NX08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD8Q9NX08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD8Q9NX08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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