Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms