Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DTX3LQ8TDB6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DTX3LQ8TDB6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms