Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COLEC12Q5KU26 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COLEC12Q5KU26 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms