Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT1Q16394 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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EXT1Q16394 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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EXT1Q16394 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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EXT1Q16394 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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EXT1Q16394 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT1Q16394 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXT1Q16394 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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