Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALCOCO2Q13137 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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