Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 MRPL25YGR076C 474 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 MPD2YOL088C 834 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 PIN2YOR104W 849 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 ENV7YPL236C 1095 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 ALR1YOL130W 2580 nt7.54□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 ABD1YBR236C 1311 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 MRN1YPL184C 1839 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 YDL162CYDL162C 357 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 RRG1YDR065W 1098 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 TOM40YMR203W 1164 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 CIN2YPL241C 807 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 YBR063CYBR063C 1215 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 ECM18YDR125C 1362 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 YEF1YEL041W 1488 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 DPB2YPR175W 2070 nt7.53□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 SPR3YGR059W 1539 nt7.52□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 HST1YOL068C 1512 nt7.52□□□□□ -1.2
SRF1Q12516 SPO74YGL170C 1242 nt7.52□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 HST2YPL015C 1074 nt7.52□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YPL034WYPL034W 498 nt7.52□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 TFC6YDR362C 2019 nt7.52□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ADE17YMR120C 1779 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 OPT1YJL212C 2400 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 MPC2YHR162W 390 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 GAT4YIR013C 366 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 RPC25YKL144C 639 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CAR2YLR438W 1275 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 TOM7YNL070W 183 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 NRK1YNL129W 723 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CAF40YNL288W 1122 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CPR8YNR028W 927 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YBR053CYBR053C 1077 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 SUI3YPL237W 858 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YEN1YER041W 2280 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YLR345WYLR345W 1530 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CTF13YMR094W 1437 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 SRO9YCL037C 1305 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CHS5YLR330W 2016 nt7.51□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YDL124WYDL124W 939 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 PDS1YDR113C 1122 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 RPN11YFR004W 921 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CPR6YLR216C 1116 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 MRPL16YBL038W 699 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YBL062WYBL062W 381 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 MDH2YOL126C 1134 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YOR152CYOR152C 771 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ATP4YPL078C 735 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 NBA1YOL070C 1506 nt7.5□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YLL058WYLL058W 1728 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ALG1YBR110W 1350 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 AIR2YDL175C 1035 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 LSM4YER112W 564 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CBT1YKL208W 816 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ECM1YAL059W 639 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 PNP1YLR209C 936 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 AAH1YNL141W 1044 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CSI2YOL007C 1026 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YPR109WYPR109W 885 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CIR2YOR356W 1896 nt7.49□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 MNN10YDR245W 1182 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YEL028WYEL028W 462 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YGL138CYGL138C 1038 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YIP5YGL161C 933 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 DSD1YGL196W 1287 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 LAC1YKL008C 1257 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 MIA40YKL195W 1212 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YOR024WYOR024W 324 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 CKB2YOR039W 777 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 LEA1YPL213W 717 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 PBI1YPL272C 1554 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 RRP7YCL031C 894 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ABP1YCR088W 1779 nt7.48□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 QRI7YDL104C 1224 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 PSR1YLL010C 1284 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 SHE1YBL031W 1017 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YPR012WYPR012W 255 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 YPR142CYPR142C 564 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 ERG1YGR175C 1491 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 DHH1YDL160C 1521 nt7.47□□□□□ -1.21
SRF1Q12516 NRG1YDR043C 696 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 BTN2YGR142W 1233 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 CIR1YGR207C 786 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 LNP1YHR192W 837 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YKL123WYKL123W 381 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR042CYLR042C 486 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YAR061WYAR061W 204 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 NPT1YOR209C 1290 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MRL1YPR079W 1146 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YNR066CYNR066C 1311 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 CEG1YGL130W 1380 nt7.46□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MDL2YPL270W 2322 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MPO1YGL010W 525 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 TAN1YGL232W 870 nt7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.2 ms