Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 ALD6YPL061W 1503 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 YDL034WYDL034W 345 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 CAD1YDR423C 1230 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 YNR048WYNR048W 1182 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 RRT2YBR246W 1164 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 UBA1YKL210W 3075 nt5.3□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 DBP9YLR276C 1785 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 SRP101YDR292C 1866 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 ENP1YBR247C 1452 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 RHB1YCR027C 630 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 MTQ2YDR140W 666 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 DON1YDR273W 1098 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 YDR396WYDR396W 501 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 YGR176WYGR176W 348 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 PGU1YJR153W 1086 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 DAL82YNL314W 768 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 ACC1YNR016C 6702 nt5.29□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 YIL060WYIL060W 435 nt5.28□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 RHO2YNL090W 579 nt5.28□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 UBC4YBR082C 447 nt5.28□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 BRL1YHR036W 1416 nt5.28□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 GEP3YOR205C 1671 nt5.28□□□□□ -1.56
RRP42Q12277 ADY2YCR010C 852 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 VMS1YDR049W 1899 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 EFM4YIL064W 774 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 RPT1YKL145W 1404 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YMR027WYMR027W 1413 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 TAH18YPR048W 1872 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 DDC1YPL194W 1839 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 RTT106YNL206C 1368 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 EIS1YMR031C 2532 nt5.27□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.26□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 MAL11YGR289C 1851 nt5.26□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YAP1801YHR161C 1914 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 TBF1YPL128C 1689 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 HEM3YDL205C 984 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 CWC21YDR482C 408 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YDR541CYDR541C 1035 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 SCW4YGR279C 1161 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 MPM1YJL066C 759 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YJR115WYJR115W 510 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 HOR7YMR251W-A 180 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 PGA2YNL149C 390 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YGL036WYGL036W 2730 nt5.25□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 DED81YHR019C 1665 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 VPS1YKR001C 2115 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 SFB3YHR098C 2790 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 OXP1YKL215C 3861 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 COS9YKL219W 1224 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 COX17YLL009C 210 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 ARG1YOL058W 1263 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 ODC2YOR222W 924 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 ECM3YOR092W 1842 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YHR045WYHR045W 1683 nt5.24□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 CBC2YPL178W 627 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 YPR098CYPR098C 486 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 ACF2YLR144C 2340 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 VTH1YIL173W 4650 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 VTH2YJL222W 4650 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 SEC12YNR026C 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 ATG17YLR423C 1254 nt5.22□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 MTQ1YNL063W 945 nt5.22□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 UTP9YHR196W 1728 nt5.22□□□□□ -1.57
RRP42Q12277 TRP3YKL211C 1455 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 TAX4YJL083W 1815 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 CDC43YGL155W 1131 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 VMA16YHR026W 642 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 APN1YKL114C 1104 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 SUE1YPR151C 621 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 RPO26YPR187W 468 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 TNA1YGR260W 1605 nt5.21□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 HRP1YOL123W 1605 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 CCZ1YBR131W 2115 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 ASH1YKL185W 1767 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 YLR296WYLR296W 327 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 KTR3YBR205W 1215 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 TOS4YLR183C 1470 nt5.2□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 RGT1YKL038W 3513 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 BNA5YLR231C 1362 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 ARP2YDL029W 1176 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 NCS6YGL211W 1080 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 VAM7YGL212W 951 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 YBL044WYBL044W 369 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 PDH1YPR002W 1551 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 PPR1YLR014C 2715 nt5.19□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 GLO2YDR272W 825 nt5.18□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 SYN8YAL014C 768 nt5.18□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 GPM3YOL056W 912 nt5.18□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 PIF1YML061C 2580 nt5.18□□□□□ -1.58
RRP42Q12277 TIM54YJL054W 1437 nt5.17□□□□□ -1.58
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