Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 REF2YDR195W 1602 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 SIP5YMR140W 1470 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 HIP1YGR191W 1812 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 UTH1YKR042W 1098 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 SIC1YLR079W 855 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 COQ9YLR201C 783 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 CCS1YMR038C 750 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YPR078CYPR078C 1119 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 GRX1YCL035C 333 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 ATF1YOR377W 1578 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 DAS2YDR020C 699 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 MET28YIR017C 564 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 STE18YJR086W 333 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 TTI2YJR136C 1266 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YLR257WYLR257W 966 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YML003WYML003W 873 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 ATP19YOL077W-A 207 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 PET123YOR158W 957 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YOR199WYOR199W 330 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RIM2YBR192W 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 ITR2YOL103W 1830 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 CLB3YDL155W 1284 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RML2YEL050C 1182 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 CWC23YGL128C 852 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RRP46YGR095C 672 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RPL27AYHR010W 411 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RPC17YJL011C 486 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 MRT4YKL009W 711 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 PRM9YAR031W 897 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YLR184WYLR184W 348 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YNL120CYNL120C 486 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 PFA3YNL326C 1011 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 HST2YPL015C 1074 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 ATR1YML116W 1629 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YMR265CYMR265C 1386 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 TAT2YOL020W 1779 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 SPS2YDR522C 1509 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 TPN1YGL186C 1740 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 VCX1YDL128W 1236 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 UGX2YDL169C 672 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 RPL4BYDR012W 1089 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 LYS5YGL154C 819 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 MRP4YHL004W 1185 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 PEP8YJL053W 1140 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YJL218WYJL218W 591 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 HOT13YKL084W 351 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YML053CYML053C 639 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 AAD14YNL331C 1131 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 LEU4YNL104C 1860 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-BRQ12217 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 SNF11YDR073W 510 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 GRH1YDR517W 1119 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 BGL2YGR282C 942 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 AIM1YAL046C 357 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YNL324WYNL324W 396 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 FMP23YBR047W 528 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YPR130CYPR130C 408 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 MSF1YPR047W 1410 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 CUS1YMR240C 1311 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 TOS4YLR183C 1470 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 SAM2YDR502C 1155 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 LSM5YER146W 282 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 DDI2YFL061W 678 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 DDI3YNL335W 678 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 MVD1YNR043W 1191 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YOR114WYOR114W 885 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 ICS2YBR157C 768 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 WSC4YHL028W 1818 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RDS2YPL133C 1341 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 AKR2YOR034C 2250 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YER156CYER156C 1017 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 FOL2YGR267C 732 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 LEU5YHR002W 1074 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RPS10BYMR230W 318 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 COQ2YNR041C 1119 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 UFE1YOR075W 1041 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 MUP3YHL036W 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YCK1YHR135C 1617 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YEH1YLL012W 1722 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 GDA1YEL042W 1557 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 CSM1YCR086W 573 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 BUG1YDL099W 1026 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RAD55YDR076W 1221 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 TAF10YDR167W 621 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 ECM11YDR446W 909 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 EDC2YER035W 438 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RPL24BYGR148C 468 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 ARC15YIL062C 465 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 AUR1YKL004W 1206 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YSR3YKR053C 1215 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 YLR339CYLR339C 552 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RAS2YNL098C 969 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 RPC31YNL151C 756 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 ATP23YNR020C 813 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 BSD2YBR290W 966 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-BRQ12217 ALP1YNL270C 1722 nt7.55□□□□□ -1.2
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