Protein–RNA interactions for Protein: Q03557

HER2, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER2Q03557 PYC1YGL062W 3537 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 PRO3YER023W 861 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 SLO1YER180C-A 258 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 RPL7AYGL076C 735 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 RPL7BYPL198W 735 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 ROG3YFR022W 2202 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 YGL036WYGL036W 2730 nt5.68□□□□□ -1.5
HER2Q03557 ATG17YLR423C 1254 nt5.67□□□□□ -1.5
HER2Q03557 YOR318CYOR318C 306 nt5.67□□□□□ -1.5
HER2Q03557 VMA4YOR332W 702 nt5.67□□□□□ -1.5
HER2Q03557 SOG2YOR353C 2376 nt5.67□□□□□ -1.5
HER2Q03557 TFC6YDR362C 2019 nt5.67□□□□□ -1.5
HER2Q03557 TNA1YGR260W 1605 nt5.66□□□□□ -1.5
HER2Q03557 MAL11YGR289C 1851 nt5.66□□□□□ -1.5
HER2Q03557 CWC21YDR482C 408 nt5.66□□□□□ -1.5
HER2Q03557 CPA1YOR303W 1236 nt5.66□□□□□ -1.5
HER2Q03557 CLB1YGR108W 1416 nt5.65□□□□□ -1.5
HER2Q03557 TRK2YKR050W 2670 nt5.65□□□□□ -1.51
HER2Q03557 MMP1YLL061W 1752 nt5.65□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YFR006WYFR006W 1608 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 MHR1YDR296W 681 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 IPI1YHR085W 1005 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SFC1YJR095W 969 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SAM4YPL273W 978 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 UGO1YDR470C 1509 nt5.64□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SMF2YHR050W 1650 nt5.63□□□□□ -1.51
HER2Q03557 HST2YPL015C 1074 nt5.63□□□□□ -1.51
HER2Q03557 CBC2YPL178W 627 nt5.63□□□□□ -1.51
HER2Q03557 VBA1YMR088C 1689 nt5.63□□□□□ -1.51
HER2Q03557 EPS1YIL005W 2106 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 GET3YDL100C 1065 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SNZ3YFL059W 897 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YHR127WYHR127W 732 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YKL223WYKL223W 333 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SNZ2YNL333W 897 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 EMW1YNL313C 2715 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 RPT1YKL145W 1404 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 STL1YDR536W 1710 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 NDC1YML031W 1968 nt5.62□□□□□ -1.51
HER2Q03557 UBA1YKL210W 3075 nt5.61□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YLR296WYLR296W 327 nt5.61□□□□□ -1.51
HER2Q03557 SWP1YMR149W 861 nt5.61□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YNR048WYNR048W 1182 nt5.61□□□□□ -1.51
HER2Q03557 GSY2YLR258W 2118 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YEH1YLL012W 1722 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 GFD1YMR255W 567 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 BBP1YPL255W 1158 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 PHO8YDR481C 1701 nt5.6□□□□□ -1.51
HER2Q03557 GPT2YKR067W 2232 nt5.59□□□□□ -1.51
HER2Q03557 YDR401WYDR401W 564 nt5.59□□□□□ -1.51
HER2Q03557 OST3YOR085W 1053 nt5.59□□□□□ -1.51
HER2Q03557 OPT1YJL212C 2400 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 RRP45YDR280W 918 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 TDH3YGR192C 999 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YNL019CYNL019C 855 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YNL033WYNL033W 855 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 RPS15YOL040C 429 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 RBD2YPL246C 789 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 MID1YNL291C 1647 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 TOS4YLR183C 1470 nt5.58□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YHR045WYHR045W 1683 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ORM1YGR038W 669 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YLR122CYLR122C 378 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ATP14YLR295C 375 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ODC2YOR222W 924 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 VPS1YKR001C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 QDR3YBR043C 2070 nt5.57□□□□□ -1.52
HER2Q03557 CDC11YJR076C 1248 nt5.56□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ETR1YBR026C 1143 nt5.56□□□□□ -1.52
HER2Q03557 TEF1YPR080W 1377 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 TEF2YBR118W 1377 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 UBC4YBR082C 447 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 HIR1YBL008W 2523 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 RIM101YHL027W 1878 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 DPH2YKL191W 1605 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ECM3YOR092W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 PAP2YOL115W 1755 nt5.55□□□□□ -1.52
HER2Q03557 RRN3YKL125W 1884 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 UTP7YER082C 1665 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 GEP3YOR205C 1671 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YJL193WYJL193W 1209 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 YPR195CYPR195C 330 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ERG7YHR072W 2196 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 MTC1YJL123C 1437 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 MSS1YMR023C 1581 nt5.54□□□□□ -1.52
HER2Q03557 IMA2YOL157C 1770 nt5.53□□□□□ -1.52
HER2Q03557 POM33YLL023C 840 nt5.53□□□□□ -1.52
HER2Q03557 TAX4YJL083W 1815 nt5.53□□□□□ -1.52
HER2Q03557 ATP1YBL099W 1638 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 ICE2YIL090W 1476 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 ACF2YLR144C 2340 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 TOM20YGR082W 552 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 YJL068CYJL068C 900 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 MSN2YMR037C 2115 nt5.52□□□□□ -1.53
HER2Q03557 YNR042WYNR042W 429 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.8 ms