Protein–RNA interactions for Protein: Q03375

CWC21, Pre-mRNA-splicing factor CWC21, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC21Q03375 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YLR118CYLR118C 684 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 ODC2YOR222W 924 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 VMA4YOR332W 702 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.89□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 TRK2YKR050W 2670 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YGR182CYGR182C 354 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 VMA16YHR026W 642 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 VPS4YPR173C 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 ADE13YLR359W 1449 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 UGO1YDR470C 1509 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 SMF2YHR050W 1650 nt5.88□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YDL057WYDL057W 987 nt5.87□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 COX9YDL067C 180 nt5.87□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 JJJ3YJR097W 519 nt5.87□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 PGA3YML125C 939 nt5.87□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 STL1YDR536W 1710 nt5.87□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 DRS1YLL008W 2259 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 SHE10YGL228W 1734 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 IMA5YJL216C 1746 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 TIM54YJL054W 1437 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 CLP1YOR250C 1338 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YLL059CYLL059C 507 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 ERI1YPL096C-A 207 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 NUD1YOR373W 2556 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 RMD9YGL107C 1941 nt5.86□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 HXT5YHR096C 1779 nt5.85□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 GAT4YIR013C 366 nt5.85□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 CIS3YJL158C 684 nt5.85□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 MID1YNL291C 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.85□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 BUD14YAR014C 2130 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 VMA13YPR036W 1437 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YDL034WYDL034W 345 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 COS9YKL219W 1224 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 MRPL13YKR006C 795 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YML6YML025C 861 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 YEH1YLL012W 1722 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 HIR1YBL008W 2523 nt5.84□□□□□ -1.47
CWC21Q03375 ENP1YBR247C 1452 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RMA1YKL132C 1293 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 CBC2YPL178W 627 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 snR32snR32 188 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YCL041CYCL041C 495 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YDR514CYDR514C 1452 nt5.83□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 NOB1YOR056C 1380 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 PKC1YBL105C 3456 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RPL7AYGL076C 735 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 PRM10YJL108C 1152 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YKL151CYKL151C 1014 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 SEC13YLR208W 894 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RPL7BYPL198W 735 nt5.82□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 ATP1YBL099W 1638 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 QDR3YBR043C 2070 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RPL12AYEL054C 498 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 PNP1YLR209C 936 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 GFD1YMR255W 567 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YPL062WYPL062W 405 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RPT1YKL145W 1404 nt5.81□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 CST6YIL036W 1764 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 MMP1YLL061W 1752 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 IES1YFL013C 2079 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 SLO1YER180C-A 258 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 ERG3YLR056W 1098 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 ROG3YFR022W 2202 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 NOP7YGR103W 1818 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 OXP1YKL215C 3861 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 AIM17YHL021C 1398 nt5.8□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 CSC1YLR241W 2349 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 PPM1YDR435C 987 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 PHM8YER037W 966 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 LDB18YLL049W 540 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YNR048WYNR048W 1182 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 OST3YOR085W 1053 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 GEP3YOR205C 1671 nt5.79□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 MCM6YGL201C 3054 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 TOS4YLR183C 1470 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 MHR1YDR296W 681 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RPS15YOL040C 429 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 VPS5YOR069W 2028 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 HSP26YBR072W 645 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 UTP7YER082C 1665 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 YJR015WYJR015W 1533 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 TEF1YPR080W 1377 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 TEF2YBR118W 1377 nt5.78□□□□□ -1.48
CWC21Q03375 RGD1YBR260C 2001 nt5.77□□□□□ -1.49
CWC21Q03375 SOG2YOR353C 2376 nt5.77□□□□□ -1.49
CWC21Q03375 IDP1YDL066W 1287 nt5.77□□□□□ -1.49
CWC21Q03375 RPT6YGL048C 1218 nt5.77□□□□□ -1.49
CWC21Q03375 RBD2YPL246C 789 nt5.77□□□□□ -1.49
CWC21Q03375 SAM4YPL273W 978 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.2 ms