Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2IP63279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2IP63279 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2IP63279 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms