Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK1P39086 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIK1P39086 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK1P39086 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms