Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 SET5YHR207C 1581 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 COX17YLL009C 210 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 CRZ1YNL027W 2037 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 AVO1YOL078W 3531 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 PIN2YOR104W 849 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 RET1YOR207C 3450 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 REG2YBR050C 1017 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 ARR3YPR201W 1215 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 PDB1YBR221C 1101 nt5.61□□□□□ -1.51
NDI1P32340 EPS1YIL005W 2106 nt5.6□□□□□ -1.51
NDI1P32340 TKL1YPR074C 2043 nt5.6□□□□□ -1.51
NDI1P32340 SSP120YLR250W 705 nt5.6□□□□□ -1.51
NDI1P32340 MRPL36YBR122C 534 nt5.6□□□□□ -1.51
NDI1P32340 TNA1YGR260W 1605 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 CDC19YAL038W 1503 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 APM4YOL062C 1476 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 YDL172CYDL172C 480 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 SIP2YGL208W 1248 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 SYF2YGR129W 648 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 PGA3YML125C 939 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 SEC17YBL050W 879 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 MRP51YPL118W 1035 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 GEX1YCL073C 1848 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 GEX2YKR106W 1848 nt5.59□□□□□ -1.51
NDI1P32340 TEF1YPR080W 1377 nt5.58□□□□□ -1.52
NDI1P32340 TEF2YBR118W 1377 nt5.58□□□□□ -1.52
NDI1P32340 ENT2YLR206W 1842 nt5.58□□□□□ -1.52
NDI1P32340 BAP2YBR068C 1830 nt5.58□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RHO4YKR055W 876 nt5.58□□□□□ -1.52
NDI1P32340 MRP17YKL003C 396 nt5.57□□□□□ -1.52
NDI1P32340 CWC27YPL064C 906 nt5.57□□□□□ -1.52
NDI1P32340 UTP7YER082C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 MCM6YGL201C 3054 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 SNF11YDR073W 510 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 COX26YDR119W-A 201 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 GEP5YLR091W 882 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 MKC7YDR144C 1791 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 SCT1YBL011W 2280 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 SHE10YGL228W 1734 nt5.56□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RNR3YIL066C 2610 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 ATG18YFR021W 1503 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YIL060WYIL060W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RPR2YIR015W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 MTC2YKL098W 1074 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 TFS1YLR178C 660 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 GSY2YLR258W 2118 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 UTP18YJL069C 1785 nt5.55□□□□□ -1.52
NDI1P32340 FAT3YKL187C 2253 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YDR396WYDR396W 501 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 SFC1YJR095W 969 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 PSH1YOL054W 1221 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 HSP104YLL026W 2727 nt5.54□□□□□ -1.52
NDI1P32340 GIR2YDR152W 798 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 ADK2YER170W 678 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YGR176WYGR176W 348 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 ARP1YHR129C 1155 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 DCN1YLR128W 810 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RHO2YNL090W 579 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 CSL4YNL232W 879 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YNR048WYNR048W 1182 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RDL1YOR285W 420 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 YPR195CYPR195C 330 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 RRT2YBR246W 1164 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 ACF2YLR144C 2340 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 MKK2YPL140C 1521 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 GUP2YPL189W 1830 nt5.53□□□□□ -1.52
NDI1P32340 IRC7YFR055W 1023 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 MPM1YJL066C 759 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 YLL059CYLL059C 507 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 DAL82YNL314W 768 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 UBC4YBR082C 447 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 GEP3YOR205C 1671 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 TBF1YPL128C 1689 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 FET3YMR058W 1911 nt5.52□□□□□ -1.53
NDI1P32340 RBA50YDR527W 1320 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 RPT1YKL145W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 SEC12YNR026C 1416 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 PIF1YML061C 2580 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 YDR541CYDR541C 1035 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 PGU1YJR153W 1086 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 POR1YNL055C 852 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 ECM2YBR065C 1095 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 PEX32YBR168W 1242 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 ALT1YLR089C 1779 nt5.51□□□□□ -1.53
NDI1P32340 BRL1YHR036W 1416 nt5.5□□□□□ -1.53
NDI1P32340 YDL034WYDL034W 345 nt5.5□□□□□ -1.53
NDI1P32340 MTQ2YDR140W 666 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms