Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VAMP1P23763 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAMP1P23763 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP1P23763 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms