Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

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Length 3,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 PAU16YKL224C 372 nt14.14□□□□□ -0.15
TOM1Q03280 MXR2YCL033C 507 nt14.12□□□□□ -0.15
TOM1Q03280 PUN1YLR414C 792 nt14.11□□□□□ -0.15
TOM1Q03280 PTC2YER089C 1395 nt14.08□□□□□ -0.16
TOM1Q03280 YDR433WYDR433W 441 nt14.07□□□□□ -0.16
TOM1Q03280 YJL152WYJL152W 360 nt14.03□□□□□ -0.16
TOM1Q03280 YBL100CYBL100C 315 nt14.02□□□□□ -0.16
TOM1Q03280 CCT6YDR188W 1641 nt13.92□□□□□ -0.18
TOM1Q03280 TRM9YML014W 840 nt13.91□□□□□ -0.18
TOM1Q03280 IDH1YNL037C 1083 nt13.88□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.88□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 PRE6YOL038W 765 nt13.88□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 YKR040CYKR040C 504 nt13.88□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 YPS1YLR120C 1710 nt13.84□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 POA1YBR022W 534 nt13.84□□□□□ -0.19
TOM1Q03280 FIS1YIL065C 468 nt13.8□□□□□ -0.2
TOM1Q03280 NAB2YGL122C 1578 nt13.79□□□□□ -0.2
TOM1Q03280 YFR018CYFR018C 1092 nt13.77□□□□□ -0.2
TOM1Q03280 FPR4YLR449W 1179 nt13.76□□□□□ -0.21
TOM1Q03280 FUN26YAL022C 1554 nt13.74□□□□□ -0.21
TOM1Q03280 DED1YOR204W 1815 nt13.71□□□□□ -0.22
TOM1Q03280 YLR235CYLR235C 399 nt13.67□□□□□ -0.22
TOM1Q03280 BUD23YCR047C 828 nt13.65□□□□□ -0.22
TOM1Q03280 PTH1YHR189W 573 nt13.65□□□□□ -0.22
TOM1Q03280 DAL1YIR027C 1383 nt13.63□□□□□ -0.23
TOM1Q03280 SNF6YHL025W 999 nt13.63□□□□□ -0.23
TOM1Q03280 RRT5YFR032C 870 nt13.62□□□□□ -0.23
TOM1Q03280 PHO4YFR034C 939 nt13.6□□□□□ -0.23
TOM1Q03280 GBP2YCL011C 1284 nt13.6□□□□□ -0.23
TOM1Q03280 INM2YDR287W 879 nt13.54□□□□□ -0.24
TOM1Q03280 FRD1YEL047C 1413 nt13.52□□□□□ -0.25
TOM1Q03280 LCB1YMR296C 1677 nt13.49□□□□□ -0.25
TOM1Q03280 YKL030WYKL030W 606 nt13.45□□□□□ -0.26
TOM1Q03280 TIR4YOR009W 1464 nt13.45□□□□□ -0.26
TOM1Q03280 YFL066CYFL066C 1179 nt13.42□□□□□ -0.26
TOM1Q03280 TCD2YKL027W 1344 nt13.39□□□□□ -0.27
TOM1Q03280 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.37□□□□□ -0.27
TOM1Q03280 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.37□□□□□ -0.27
TOM1Q03280 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.36□□□□□ -0.27
TOM1Q03280 DIC1YLR348C 897 nt13.35□□□□□ -0.27
TOM1Q03280 YMR244WYMR244W 1068 nt13.32□□□□□ -0.28
TOM1Q03280 RAD51YER095W 1203 nt13.31□□□□□ -0.28
TOM1Q03280 CAC2YML102W 1407 nt13.29□□□□□ -0.28
TOM1Q03280 GLR1YPL091W 1452 nt13.27□□□□□ -0.29
TOM1Q03280 ART5YGR068C 1761 nt13.21□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 NAT4YMR069W 858 nt13.19□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 RRD1YIL153W 1182 nt13.19□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 YMR057CYMR057C 372 nt13.19□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 RPM1RPM1 483 nt13.17□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 TIM23YNR017W 669 nt13.17□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.15□□□□□ -0.3
TOM1Q03280 ALF1YNL148C 765 nt13.12□□□□□ -0.31
TOM1Q03280 YCL042WYCL042W 360 nt13.11□□□□□ -0.31
TOM1Q03280 MSF1YPR047W 1410 nt13.05□□□□□ -0.32
TOM1Q03280 YLR179CYLR179C 606 nt13.04□□□□□ -0.32
TOM1Q03280 FMT1YBL013W 1206 nt13.03□□□□□ -0.32
TOM1Q03280 GLK1YCL040W 1503 nt13.03□□□□□ -0.32
TOM1Q03280 FPS1YLL043W 2010 nt13.02□□□□□ -0.33
TOM1Q03280 RBG2YGR173W 1107 nt13.01□□□□□ -0.33
TOM1Q03280 YPR064WYPR064W 420 nt13□□□□□ -0.33
TOM1Q03280 SOR2YDL246C 1074 nt12.94□□□□□ -0.34
TOM1Q03280 SOR1YJR159W 1074 nt12.94□□□□□ -0.34
TOM1Q03280 YNL115CYNL115C 1935 nt12.9□□□□□ -0.34
TOM1Q03280 MIR1YJR077C 936 nt12.89□□□□□ -0.35
TOM1Q03280 GFD2YCL036W 1701 nt12.85□□□□□ -0.35
TOM1Q03280 YDR095CYDR095C 411 nt12.85□□□□□ -0.35
TOM1Q03280 PEX25YPL112C 1185 nt12.84□□□□□ -0.35
TOM1Q03280 WSC2YNL283C 1512 nt12.83□□□□□ -0.35
TOM1Q03280 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
TOM1Q03280 RPP2AYOL039W 321 nt12.78□□□□□ -0.36
TOM1Q03280 SAM1YLR180W 1149 nt12.75□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 YLR349WYLR349W 507 nt12.73□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 NDI1YML120C 1542 nt12.73□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 CWP1YKL096W 720 nt12.72□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 THI74YDR438W 1113 nt12.71□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 RTS2YOR077W 699 nt12.71□□□□□ -0.37
TOM1Q03280 RBG1YAL036C 1110 nt12.69□□□□□ -0.38
TOM1Q03280 YGL034CYGL034C 366 nt12.67□□□□□ -0.38
TOM1Q03280 YNR029CYNR029C 1290 nt12.66□□□□□ -0.38
TOM1Q03280 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.64□□□□□ -0.39
TOM1Q03280 PET9YBL030C 957 nt12.63□□□□□ -0.39
TOM1Q03280 ADH7YCR105W 1086 nt12.61□□□□□ -0.39
TOM1Q03280 AHT1YHR093W 549 nt12.61□□□□□ -0.39
TOM1Q03280 TAD3YLR316C 969 nt12.6□□□□□ -0.39
TOM1Q03280 BDH1YAL060W 1149 nt12.58□□□□□ -0.4
TOM1Q03280 PTP1YDL230W 1008 nt12.58□□□□□ -0.4
TOM1Q03280 FMP52YER004W 696 nt12.54□□□□□ -0.4
TOM1Q03280 DAT1YML113W 747 nt12.52□□□□□ -0.41
TOM1Q03280 STE4YOR212W 1272 nt12.5□□□□□ -0.41
TOM1Q03280 ADH2YMR303C 1047 nt12.49□□□□□ -0.41
TOM1Q03280 VPS75YNL246W 795 nt12.45□□□□□ -0.42
TOM1Q03280 YSP3YOR003W 1437 nt12.43□□□□□ -0.42
TOM1Q03280 UBA4YHR111W 1323 nt12.42□□□□□ -0.42
TOM1Q03280 XYL2YLR070C 1071 nt12.41□□□□□ -0.42
TOM1Q03280 ALG3YBL082C 1377 nt12.4□□□□□ -0.42
TOM1Q03280 PCM1YEL058W 1674 nt12.38□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 DCW1YKL046C 1350 nt12.37□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 PAU15YIR041W 375 nt12.36□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 RNQ1YCL028W 1218 nt12.36□□□□□ -0.43
TOM1Q03280 MEP2YNL142W 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
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