Protein–RNA interactions for Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-205ENST00000597371 1081 ntTSL 317.75■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-208ENST00000495367 567 ntTSL 316■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-207ENST00000484829 1044 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-208ENST00000601736 491 ntTSL 213.95□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-204ENST00000595490 410 ntTSL 313.73□□□□□ -0.216e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 213.22□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-203ENST00000595077 2465 nt13.15□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.616e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 UNC13D-215ENST00000591563 4382 ntTSL 211.11□□□□□ -0.636e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 57.27□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 34.8
RPS11P62280 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.97□□□□□ -1.618e-16■■■■■ 34.8
RPS11P62280 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 52.15□□□□□ -2.072e-8■■■■■ 34.8
RPS11P62280 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 51.91□□□□□ -2.12e-8■■■■■ 34.8
RPS11P62280 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 51.72□□□□□ -2.132e-8■■■■■ 34.8
RPS11P62280 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.252e-8■■■■■ 34.8
RPS11P62280 EGFL7-207ENST00000492862 723 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 32.4
RPS11P62280 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 514.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 32.4
RPS11P62280 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.192e-16■■■■■ 31.9
RPS11P62280 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 29.5
RPS11P62280 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 29.5
RPS11P62280 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 LUC7L2-203ENST00000435096 570 ntTSL 315□□□□□ -0.014e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 411.41□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 310.3□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 310.05□□□□□ -0.84e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 57.16□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.434e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 25.3
RPS11P62280 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 24.2
RPS11P62280 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 24.2
RPS11P62280 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 24.2
RPS11P62280 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24
RPS11P62280 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 32.2□□□□□ -2.062e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 31.87□□□□□ -2.112e-6■■■■□ 23.8
RPS11P62280 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.421e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)23.22■■□□□ 1.318e-8■■■■□ 22.9
RPS11P62280 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.068e-8■■■■□ 22.9
RPS11P62280 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.628e-8■■■■□ 22.9
RPS11P62280 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.288e-8■■■■□ 22.9
RPS11P62280 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 211.79□□□□□ -0.528e-8■■■■□ 22.9
RPS11P62280 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 510.96□□□□□ -0.659e-14■■■■□ 22.2
RPS11P62280 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.19e-14■■■■□ 22.2
RPS11P62280 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 21.6
RPS11P62280 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.524e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 26.38□□□□□ -1.394e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 56.09□□□□□ -1.434e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.524e-8■■■■□ 20.8
RPS11P62280 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 319.27■□□□□ 0.688e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 416.73■□□□□ 0.278e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 415.8■□□□□ 0.128e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.098e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 212.27□□□□□ -0.458e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 212.22□□□□□ -0.458e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.548e-9■■■■□ 20.6
RPS11P62280 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 518.07■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 17.9
RPS11P62280 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 17.9
RPS11P62280 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.545e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.265e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.375e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.45e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.425e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.445e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.535e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-203ENST00000535520 1626 ntTSL 25.19□□□□□ -1.585e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-217ENST00000543809 1667 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.745e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.895e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-213ENST00000542801 502 ntTSL 43.11□□□□□ -1.915e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 CCDC91-210ENST00000540401 1439 ntTSL 1 (best)2.09□□□□□ -2.075e-9■■■□□ 17.7
RPS11P62280 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 17.4
RPS11P62280 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.841e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.25□□□□□ -1.411e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 43.03□□□□□ -1.921e-323■■■□□ 17.3
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