Protein–RNA interactions for Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 EDA-202ENST00000374548 1116 ntTSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.921e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-212ENST00000533317 1462 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.841e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-205ENST00000502251 1167 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 313.28□□□□□ -0.281e-323■■■□□ 15.9
RPS11P62280 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-323■■□□□ 12.9
RPS11P62280 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-323■■□□□ 12.9
RPS11P62280 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 440.9
RPS11P62280 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 210.81□□□□□ -0.681e-323■■□□□ 12.9
RPS11P62280 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC9.93□□□□□ -0.821e-323■■□□□ 11.6
RPS11P62280 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-323■■■□□ 16.3
RPS11P62280 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.051e-323■■■□□ 16.3
RPS11P62280 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-323■■■□□ 16.3
RPS11P62280 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.351e-323■■□□□ 12
RPS11P62280 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.361e-323■■■□□ 16.3
RPS11P62280 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 56.25□□□□□ -1.411e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 EDA-207ENST00000510681 536 ntTSL 43.03□□□□□ -1.921e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.961e-323■■■□□ 16.3
RPS11P62280 EDA-211ENST00000530321 339 ntTSL 22.6□□□□□ -1.991e-323■■■□□ 17.3
RPS11P62280 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.151e-323■■□□□ 11.5
RPS11P62280 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.381e-323■■□□□ 12.1
RPS11P62280 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.431e-323■□□□□ 10.2
RPS11P62280 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.461e-323■□□□□ 9.4
RPS11P62280 FAM234B-202ENST00000416494 2623 ntTSL 210.34□□□□□ -0.751e-73■□□□□ 10.5
RPS11P62280 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-73■□□□□ 10.5
RPS11P62280 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.52□□□□□ -1.212e-68■■□□□ 13.2
RPS11P62280 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.57□□□□□ -0.561e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt9.55□□□□□ -0.881e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt9.47□□□□□ -0.891e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC10.37□□□□□ -0.757e-29■■□□□ 12.7
RPS11P62280 AL627171.2-202ENST00000634923 923 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.137e-29■■□□□ 12.7
RPS11P62280 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.247e-29■■□□□ 12.7
RPS11P62280 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.274e-28■□□□□ 11.2
RPS11P62280 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.543e-27■□□□□ 8.1
RPS11P62280 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-27■□□□□ 8.1
RPS11P62280 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.271e-26■■■■■ 104.6
RPS11P62280 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-26■■■■■ 104.6
RPS11P62280 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-25■■■□□ 16.1
RPS11P62280 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.624e-25■■■□□ 16.1
RPS11P62280 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.78e-22■■□□□ 13.7
RPS11P62280 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 310.28□□□□□ -0.768e-22■■□□□ 13.7
RPS11P62280 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 47.6□□□□□ -1.198e-22■■□□□ 13.7
RPS11P62280 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.138e-22■■□□□ 13.7
RPS11P62280 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.847e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.737e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.137e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 518.55■□□□□ 0.561e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.421e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-19■■■■□ 23
RPS11P62280 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-19■■□□□ 13.4
RPS11P62280 SNHG25-201ENST00000580828 106 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-19■■□□□ 13.4
RPS11P62280 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.683e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.253e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 317.86■□□□□ 0.455e-19■□□□□ 11.1
RPS11P62280 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.638e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 216.77■□□□□ 0.288e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.888e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 57.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 37.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.22□□□□□ -1.258e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.27□□□□□ -2.058e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.43□□□□□ -2.188e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.23□□□□□ -2.218e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.348e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.192e-16■■■■■ 31.9
RPS11P62280 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.97□□□□□ -1.618e-16■■■■■ 34.8
RPS11P62280 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 521.33■■□□□ 1.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 54.42□□□□□ -1.71e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 43.96□□□□□ -1.781e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 52.52□□□□□ -2.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.151e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.692e-15■■□□□ 12.3
RPS11P62280 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-14■■■□□ 16.9
RPS11P62280 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.375e-14■■□□□ 14.4
RPS11P62280 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.865e-14■■□□□ 14.4
RPS11P62280 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.285e-14■■□□□ 14.4
RPS11P62280 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 510.96□□□□□ -0.659e-14■■■■□ 22.2
RPS11P62280 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.19e-14■■■■□ 22.2
RPS11P62280 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-13■□□□□ 9.6
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