Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN6Q9Y6Q1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
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