Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHCBP1LQ9BZQ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms