Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNM3Q9BZ71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNM3Q9BZ71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNM3Q9BZ71 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms