Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF555Q8NEP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF555Q8NEP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF555Q8NEP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms