Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 COA1YIL157C 594 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 MRPL4YLR439W 960 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 TSA1YML028W 591 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 MRPS16YPL013C 366 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 SKS1YPL026C 1509 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 HIS7YBR248C 1659 nt7.06□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 MKC7YDR144C 1791 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 PAF1YBR279W 1338 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 VMS1YDR049W 1899 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 GIT1YCR098C 1557 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YDL121CYDL121C 450 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 IRC7YFR055W 1023 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 TRP5YGL026C 2124 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YIL086CYIL086C 309 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 OAC1YKL120W 975 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 NMD4YLR363C 657 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YOL050CYOL050C 321 nt7.05□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 WHI2YOR043W 1461 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 LYS21YDL131W 1323 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 VTS1YOR359W 1572 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 XPT1YJR133W 630 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YKR073CYKR073C 321 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 RPC19YNL113W 429 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 ARO9YHR137W 1542 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 IMA2YOL157C 1770 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 MDM31YHR194W 1740 nt7.04□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 DXO1YDR370C 1329 nt7.03□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 EMP65YER140W 1671 nt7.03□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YOL024WYOL024W 519 nt7.03□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 ENV7YPL236C 1095 nt7.03□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YPR109WYPR109W 885 nt7.03□□□□□ -1.28
SSF2Q12153 YMR155WYMR155W 1644 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YEL068CYEL068C 333 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 ERV14YGL054C 417 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 BCY1YIL033C 1251 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 PEX22YAL055W 543 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 SED5YLR026C 1023 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.02□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 FRE7YOL152W 1863 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YLR283WYLR283W 945 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 HAP3YBL021C 435 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 RRP40YOL142W 723 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 GPB2YAL056W 2643 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 URA7YBL039C 1740 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 HST3YOR025W 1344 nt7.01□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 SLD2YKL108W 1362 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 SIT4YDL047W 936 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 RMD5YDR255C 1266 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YGR011WYGR011W 327 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YKL169CYKL169C 384 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 CIN4YMR138W 576 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 DOM34YNL001W 1161 nt7□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 PYC2YBR218C 3543 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YLH47YPR125W 1365 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 GIP2YER054C 1647 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 PSR1YLL010C 1284 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YPR114WYPR114W 948 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 PHO3YBR092C 1404 nt6.99□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 GUD1YDL238C 1470 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 EDC3YEL015W 1656 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YDL241WYDL241W 372 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 MAF1YDR005C 1188 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YDR278CYDR278C 318 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 DUS4YLR405W 1104 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 UIP4YPL186C 915 nt6.98□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 HST4YDR191W 1113 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 DIN7YDR263C 1293 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 GTT3YEL017W 1014 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 ATP12YJL180C 978 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 SPC34YKR037C 888 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 ECM19YLR390W 339 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 YBL029WYBL029W 1131 nt6.97□□□□□ -1.29
SSF2Q12153 MRPL1YDR116C 858 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 RPT3YDR394W 1287 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 SOH1YGL127C 384 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 ICS3YJL077C 396 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 ADE12YNL220W 1302 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 UGO1YDR470C 1509 nt6.96□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YGL101WYGL101W 648 nt6.95□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YHR095WYHR095W 495 nt6.95□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PYK2YOR347C 1521 nt6.95□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 SNM1YDR478W 597 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 NVJ1YHR195W 966 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YJL215CYJL215C 360 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 YJR056CYJR056C 711 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 CTR3YLR411W 726 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 MRPS12YNR036C 462 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 HRT1YOL133W 366 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 RAD24YER173W 1980 nt6.94□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 KKQ8YKL168C 2175 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 HXT3YDR345C 1704 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 PFA5YDR459C 1125 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 SPO74YGL170C 1242 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.93□□□□□ -1.3
SSF2Q12153 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.93□□□□□ -1.3
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