Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP6P35125 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP6P35125 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP6P35125 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP6P35125 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP6P35125 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP6P35125 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP6P35125 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP6P35125 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP6P35125 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP6P35125 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP6P35125 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP6P35125 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP6P35125 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP6P35125 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
USP6P35125 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP6P35125 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP6P35125 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP6P35125 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP6P35125 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP6P35125 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP6P35125 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP6P35125 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP6P35125 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP6P35125 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP6P35125 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
USP6P35125 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP6P35125 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP6P35125 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP6P35125 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP6P35125 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP6P35125 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP6P35125 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP6P35125 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
USP6P35125 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP6P35125 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP6P35125 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP6P35125 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
USP6P35125 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP6P35125 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP6P35125 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP6P35125 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP6P35125 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP6P35125 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP6P35125 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
USP6P35125 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP6P35125 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP6P35125 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP6P35125 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP6P35125 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
USP6P35125 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
USP6P35125 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP6P35125 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP6P35125 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms