Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASQ1P31415 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASQ1P31415 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CASQ1P31415 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms